摘要:目的运用分子对接技术研究补阳还五汤成分与缺血性脑卒中靶点的相互作用,探索补阳还五汤的有效物质基础及主要作用靶点。方法选取与缺血性脑卒中有关的人体46个关键蛋白靶标,从数据库中筛选个补阳还五汤活性成分,采用分子对接技术将所获得的活性分子与关键靶点对接,得到TotalScore,同时建立多成分-多靶点网络模型,再运用总量统计矩相似度法分析各靶点与所有靶点总体行为的相似性。结果通过分子对接虚拟筛选补阳还五汤治疗缺血性脑卒中的活性小分子,其中有22个成分与40个或以上蛋白靶点有较好的相互作用,虚拟筛选治疗缺血性脑卒中的主要靶点,其中22个蛋白靶点与80个或以上成分有较好的相互作用。结论基于分子对接的虚拟筛选方法可用来寻找补阳还五汤治疗缺血性脑卒中的活性成分及主要靶点,为进一步深入研究补阳还五汤治疗脑梗死的作用机制提供一定参考。

脑卒中是一种常见的难治性疾病,易复发,具高发病率、高致残率、高死亡率等特点,严重影响了患者的身体健康和生活质量,给家庭和社会经济带来沉重负担[1]。脑卒中包括缺血性脑卒中和出血性脑卒中2种,其中缺血性脑卒中占所有脑卒中的80%以上[1]。缺血性脑卒中实质是脑供血动脉被血栓堵塞,神经组织随即发生不可逆的缺血梗死,出现神经功能障碍[2-3]。补阳还五汤首载于清代医学家王清任的《医林改错?卷下?瘫痿论》[4],为中医益气活血名方,是目前治疗缺血性脑卒中疗效公认的著名方剂。该方具有“不在逐瘀以活血,重在补气以活血”的配伍特点,全方由黄芪、当归、赤芍、川芎、桃仁、红花、地龙7味药组成,生黄芪为君药,当归为臣药,赤芍、川芎、桃仁、红花为佐药,地龙为使药。临床研究表明,补阳还五汤能够降低脑梗死患者的神经功能缺损积分和中医证候积分,提高日常生活能力指数评分[5-6]。分子对接技术是通过化学计量学方法模拟小分子配体与蛋白受体的几何匹配、能量匹配,计算出两者间的作用力,以进行分子间相互作用识别并预测受体-配体复合物结构的一种方法,可用于研究成分与靶点的相互作用[7-9]。故本研究通过分子对接技术筛选补阳还五汤治疗缺血性脑卒中的物质基础及主要作用靶点,研究补阳还五汤成分与缺血性脑卒中靶点的相互作用,并构建成分-蛋白靶点网络模型,以初步阐明补阳还五汤多成分、多靶点复方效应机制,同时从配体-受体层面揭示补阳还五汤治疗脑梗死的超分子化学机制。

1材料与方法

1.1材料

本研究工作均在MicrosoftWindows7Professional操作系统中完成,采用ChemOffice程序(CambridgeSoft)中的ChemDraw模块、Sybyl-X2.0(Tripos)中的Minimize模块、Surflex-Dock模块和Cytoscape3.7.1软件。

1.2缺血性脑卒中相关靶点蛋白的获取

查阅国内外关于缺血性脑卒中的文献报道[10-14],结合临床研究报道,搜索蛋白质PDB结构数据库RCSB(



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